近日，由中南大學醫(yī)學遺傳學研究中心鄔玲仟教授和梁德生教授課題組牽頭、貝瑞基因提供技術支持的三代測序地中海貧血基因檢測技術多中心產(chǎn)前診斷臨床研究成果，發(fā)表于檢驗醫(yī)學權(quán)威國際期刊CLINICALCHEMISTRY(影響因子12.167)。

針對這一分子遺傳學重要成果，CLINICALCHEMISTRY專門發(fā)表編輯部評論文章并給予高度評價，彰顯了三代測序技術為復雜單基因病的分子診斷帶來的全新機遇，以及在臨床應用上的巨大價值及廣闊前景。

資深專家高度評價：產(chǎn)前診斷應用場景優(yōu)勢明顯

該多中心臨床研究主要針對地中海貧血(簡稱“地貧”)。由于目前尚無有效治療中間型或重型地貧的方法，產(chǎn)前診斷成為預防此類出生缺陷的有效手段。

以α、β-地貧為典型代表的復雜單基因病，在胎兒期不具備完整的可觀測的臨床表型，故分子檢測結(jié)果的精準性以及極高的陽性預測值(PPV)對于產(chǎn)前診斷的決策至關重要。加上地貧基因的高度同源性及變異的復雜多樣性，傳統(tǒng)PCR方法和短讀長的二代測序(NGS)方法并不是檢測的最佳方法。

此次研究分別基于傳統(tǒng)PCR和CATSA ( ComprehensiveAnalysisofThalassemiaAleles)方法對來自11個研究中心的278例高危妊娠羊膜穿刺術樣本進行了雙盲背靠背研究。PCR檢測出191個胎兒攜帶地貧變異基因，CATSA準確地識別出206個胎兒攜帶地貧變異基因。結(jié)果不一致樣本進一步采用Sanger測序等技術驗證，最終證實CATSA檢測結(jié)果準確性為100%。與PCR方法學相比，CATSA方法陽性檢出率顯著提高(7.9%，15/191)，其中PCR方法在檢測范圍內(nèi)出現(xiàn)4例假陰/假陽性結(jié)果。另外，CATSA方法還在11例樣本中多檢出有臨床意義的地貧基因變異。值得注意的是，CATSA檢測結(jié)果修正了8個胎兒的表型預測結(jié)果，其中一個胎兒因為傳統(tǒng)PCR方法誤診 (PCR方法提示為HBBc.52A>T純合變異，CATSA方法結(jié)果為HBBc.52A>T雜合變異)導致被錯誤終止妊娠的遺憾結(jié)局。

來自麻省理工學院和哈佛大學布羅德學院的兩位資深專家KatherineA.Laf-ferty和DianaM.Toledo同期撰文對該項臨床研究予以高度評價。

基于三代測序的創(chuàng)新性基因診斷方法相較于常規(guī)基于PCR方法，有效提高了地貧基因檢測的靈敏度、特異性、PPV和NPV，是臨床應用效能的重大進步?；贑ATSA方法在地貧產(chǎn)前診斷應用場景中的明顯優(yōu)勢，地貧產(chǎn)前診斷分子檢測應提倡采用CASTA方法聯(lián)合檢測解決方案，以便于得到一個完整準確的結(jié)果。因為當一個家庭面對自己的妊娠做出決定的時刻，假陽性或假陰性結(jié)果會造成極大的不良后果。

三代測序先發(fā)布局

得益于高保真、長讀長的三代測序技術，8%的人類基因組復雜區(qū)域終被攻克。2022年4月，被譽為生命科學“登月計劃”的人類基因組測序也迎來了完整無間隙的序列，為整個基因行業(yè)打開了一扇全新的大門。

而貝瑞基因在三代測序領域的布局也早已開啟，遵循科研先行、硬件提速、產(chǎn)品落地的原則，為打造三代測序篩查“中國方案”進行不懈探索。截至2022年底，貝瑞基因累計服務三代測序檢測樣本量突破10萬人份，服務終端客戶超過1500家。

開展多項重磅臨床研究的同時，貝瑞基因在三代測序儀上實現(xiàn)自主可控，擁有雄厚儲備。在此基礎上，公司落地了三代地貧、三代CAH(先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥)、三代SMA(脊髓性肌萎縮癥)、三代FXS(脆性X綜合征)等產(chǎn)品，并均取得發(fā)明專利證書。

值得一提的是，貝瑞基因福州數(shù)字生命產(chǎn)業(yè)園已完成三代測序應用轉(zhuǎn)化中心建設。以此為載體，貝瑞基因?qū)⑾蚋鄰碗s基因變異疾病發(fā)起挑戰(zhàn)，力求在單基因全病種的檢測上做到精準“一鍵解決”。

亓萱